Enstitümüz'de, her birimdeki akademik danışmanlıkları anabilimdalı başkanları yürütmektedir.

Avrupa Birliği Hukuku Anabilim Dalı Başkanı Prof. Dr. M. Tayyar Karayiğit,

Avrupa Birliği Siyaseti ve Uluslararası İlişkiler Anabilim Dalı Başkanı Prof. Dr. Yonca Özer,

Avrupa Birliği İktisadı ve İşletme Anabilim Dalı Başkanı Prof. Dr. Besim Bülent Bali,

Avrupa'da Siyasal İletişim Anabilim Dalı Başkanı Prof. Dr. E. Münevver Cebeci'dir.