Avrupa Araştırmaları Enstitüsü, Türkiye Cumhuriyeti'nin 1987 yılında Avrupa Topluluğu'na tam üyelik başvurusu yapmasından hemen sonra Marmara Üniversitesi Rektörlüğü'ne bağlı olarak kurulmuştur. Enstitünün temel amaçları; yüksek lisans ve doktora eğitimi vererek kamu ve özel sektör için Avrupşa Birliği konularında uzmanlar yetiştirmek, Türk sanayi ve iş dünyasının ihtiyaç duyduğu alanlarda araştırmaları kanalize etmek suretiyle azami yarar sağlamaktır. Avrupa Birliği Hukuku, İktisadı ve Siyaseti alanlarında süren tezli yüksek lisans ve doktora programları, Türkçe ve İngilizce iki dil seçeneğiyle sunulmaktadır.